Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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COL24A1Q17RW2 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
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COL24A1Q17RW2 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
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COL24A1Q17RW2 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
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COL24A1Q17RW2 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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