Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
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