Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
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