Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC106886.5-201ENST00000380361 11692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 PLXDC2-203ENST00000377252 12468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 KAT6A-203ENST00000406337 9241 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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