Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 CRBN-201ENST00000231948 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 LINC01559-201ENST00000318426 2750 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 PTPRR-202ENST00000342084 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 HSPA8P11-201ENST00000508840 1898 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
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SKIV2LQ15477 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AP000442.2-201ENST00000531108 440 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
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SKIV2LQ15477 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
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SKIV2LQ15477 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
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SKIV2LQ15477 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 ZNF816-203ENST00000357666 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SKIV2LQ15477 ENTPD5-207ENST00000557325 3096 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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