Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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DDX39BQ13838 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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DDX39BQ13838 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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DDX39BQ13838 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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DDX39BQ13838 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
DDX39BQ13838 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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