Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARL2-SNX15V9GYD0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms