Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PARP3Q9Y6F1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms