Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W3

KLF2, Krueppel-like factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF2Q9Y5W3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF2Q9Y5W3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms