Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms