Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN16Q9Y5I7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN16Q9Y5I7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN16Q9Y5I7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN16Q9Y5I7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN16Q9Y5I7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN16Q9Y5I7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN16Q9Y5I7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN16Q9Y5I7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN16Q9Y5I7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN16Q9Y5I7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN16Q9Y5I7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN16Q9Y5I7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN16Q9Y5I7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN16Q9Y5I7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN16Q9Y5I7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN16Q9Y5I7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN16Q9Y5I7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN16Q9Y5I7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN16Q9Y5I7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN16Q9Y5I7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN16Q9Y5I7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN16Q9Y5I7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN16Q9Y5I7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN16Q9Y5I7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN16Q9Y5I7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms