Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B7

MRPL11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL11Q9Y3B7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL11Q9Y3B7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL11Q9Y3B7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms