Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms