Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ05

KCNH4, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH4Q9UQ05 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNH4Q9UQ05 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH4Q9UQ05 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms