Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SETD1BQ9UPS6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms