Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCAF8Q9UPN6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAF8Q9UPN6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms