Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRQQ9UMZ3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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