Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
INO80Q9ULG1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
INO80Q9ULG1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms