Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF346Q9UL40 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms