Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms