Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
USP21Q9UK80 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
USP21Q9UK80 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
USP21Q9UK80 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
USP21Q9UK80 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
USP21Q9UK80 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP21Q9UK80 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP21Q9UK80 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP21Q9UK80 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP21Q9UK80 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP21Q9UK80 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP21Q9UK80 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP21Q9UK80 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms