Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNL1Q9UK58 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNL1Q9UK58 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms