Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA4Q9UI42 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CPA4Q9UI42 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms