Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
MLH3Q9UHC1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MLH3Q9UHC1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms