Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NKIRAS1Q9NYS0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms