Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms