Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM106BQ9NUM4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM106BQ9NUM4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM106BQ9NUM4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM106BQ9NUM4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM106BQ9NUM4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms