Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC4BQ9NT99 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.8 ms