Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms