Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNRC6CQ9HCJ0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms