Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9D4

ZNF408, Zinc finger protein 408, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF408Q9H9D4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF408Q9H9D4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms