Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLMPQ9H6B4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms