Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB1BQ9H0U4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms