Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC113Q9H0I3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC113Q9H0I3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms