Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms