Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GATA5Q9BWX5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GATA5Q9BWX5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GATA5Q9BWX5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GATA5Q9BWX5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GATA5Q9BWX5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GATA5Q9BWX5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GATA5Q9BWX5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GATA5Q9BWX5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GATA5Q9BWX5 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GATA5Q9BWX5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GATA5Q9BWX5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GATA5Q9BWX5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GATA5Q9BWX5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GATA5Q9BWX5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GATA5Q9BWX5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GATA5Q9BWX5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATA5Q9BWX5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms