Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HIGD2AQ9BW72 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms