Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSEN34Q9BSV6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSEN34Q9BSV6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms