Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms