Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POP1Q99575 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POP1Q99575 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POP1Q99575 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POP1Q99575 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POP1Q99575 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POP1Q99575 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POP1Q99575 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POP1Q99575 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POP1Q99575 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POP1Q99575 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POP1Q99575 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POP1Q99575 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POP1Q99575 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POP1Q99575 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
POP1Q99575 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POP1Q99575 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
POP1Q99575 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POP1Q99575 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POP1Q99575 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POP1Q99575 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POP1Q99575 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POP1Q99575 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
POP1Q99575 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POP1Q99575 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POP1Q99575 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POP1Q99575 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POP1Q99575 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POP1Q99575 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POP1Q99575 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POP1Q99575 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POP1Q99575 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POP1Q99575 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POP1Q99575 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POP1Q99575 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POP1Q99575 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POP1Q99575 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POP1Q99575 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POP1Q99575 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POP1Q99575 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POP1Q99575 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POP1Q99575 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POP1Q99575 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POP1Q99575 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POP1Q99575 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POP1Q99575 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POP1Q99575 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POP1Q99575 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POP1Q99575 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POP1Q99575 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POP1Q99575 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POP1Q99575 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POP1Q99575 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POP1Q99575 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POP1Q99575 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POP1Q99575 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POP1Q99575 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
POP1Q99575 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
POP1Q99575 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
POP1Q99575 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POP1Q99575 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POP1Q99575 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POP1Q99575 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POP1Q99575 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POP1Q99575 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POP1Q99575 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POP1Q99575 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
POP1Q99575 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POP1Q99575 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POP1Q99575 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POP1Q99575 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POP1Q99575 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POP1Q99575 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POP1Q99575 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POP1Q99575 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POP1Q99575 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POP1Q99575 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POP1Q99575 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POP1Q99575 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POP1Q99575 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POP1Q99575 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POP1Q99575 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POP1Q99575 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POP1Q99575 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POP1Q99575 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POP1Q99575 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POP1Q99575 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POP1Q99575 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POP1Q99575 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
POP1Q99575 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
POP1Q99575 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POP1Q99575 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POP1Q99575 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POP1Q99575 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POP1Q99575 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POP1Q99575 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POP1Q99575 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POP1Q99575 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POP1Q99575 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POP1Q99575 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms