Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms