Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC85AQ96PX6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms