Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCANQ96GW7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms