Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113Q902F9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms