Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms