Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM7

SUPT20H, Transcription factor SPT20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT20HQ8NEM7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUPT20HQ8NEM7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUPT20HQ8NEM7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUPT20HQ8NEM7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUPT20HQ8NEM7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUPT20HQ8NEM7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SUPT20HQ8NEM7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUPT20HQ8NEM7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUPT20HQ8NEM7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUPT20HQ8NEM7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUPT20HQ8NEM7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUPT20HQ8NEM7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUPT20HQ8NEM7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUPT20HQ8NEM7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUPT20HQ8NEM7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SUPT20HQ8NEM7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SUPT20HQ8NEM7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUPT20HQ8NEM7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms