Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms