Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms