Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms