Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms